แปร์นู, เอสโตเนีย ในเดือน มิถุนายน มีสภาพอากาศร้อน โดยมีอุณหภูมิสูงสุดเฉลี่ย 21.2°C มีฝนตกประมาณ 11 วันในเดือนนี้ อุณหภูมิน้ำทะเลยังคงเย็นอยู่ที่ 18.7°C
เดือนนี้อยู่ในช่วง เริ่มต้น ของ ฤดูร้อน
อุณหภูมิสูงสุดรายวันในเดือนมิถุนายนจะค่อยๆ เพิ่มขึ้นจากประมาณ 19°C ในช่วงต้นเดือนเป็น 23°C ในช่วงปลายเดือน
เดือน มิถุนายน มีปริมาณน้ำฝนค่อนข้างสม่ำเสมอ รวมประมาณ 73 mm ตลอดทั้งเดือน
วันที่อบอุ่นที่สุดมักจะอยู่ประมาณวันที่ 27 โดยมีอุณหภูมิเฉลี่ย 23.4°C